水たまりがあっても防水層に異常がなければ、
特に問題はありません。

陸屋根の場合、水がドレン（配水管のあるところ）に流れるように屋根自体に勾配をとっていますが、それが十分でない可能性も考えられます。

また、ドレンの近くに水が溜まる場合、水の流れを良くする改修方法があるので、お困りの際はお気軽にご相談ください。